一、设定船舶抵押权要不要进行登记船舶所有人抵押船舶，需要签订船舶抵押合同，由抵押权人和抵押人共同向船舶登记机关办理抵押权登记，未登记不得对抗善意第三人。《中华人民共和国海商法》第十三条 设定船舶抵押权，由抵押权人和抵押人共同向船舶登记机关办理抵押权登记;未经登记的，不得对抗第三人。船舶抵押权登记，包括下列主要项目：(一)船舶抵押权人和抵押人的姓名或者名称、地址;(二)被抵押船舶的名称、国籍、船舶所有权证书的颁发机关和证书号码;(三)所担保的债权数额、利息率、受偿期限。船舶抵押权的登记状况，允许公众查询。

二、船舶抵押权登记办理流程
1、申请及受理
(1)网上受理申请人会在网上提交申请之日起5日内，通过网络、短信、电话等方式被告知获取相关通知书。申请材料不齐全或者不符合法定形式，受理机构出具《补正材料通知书》一次性告知申请人需要补正的材料;申请事项不需要取得行政许可或不属于本机关职权范围的，受理机构出具《不予受理通知书》;逾期不告知的，自收到申请材料之日起即视为受理。
(2)窗口受理窗口工作人员在接到书面申请材料后，当即对材料进行审核。申请材料齐全的，现场出具《受理通知书》(即办件除外);申请材料不齐全或者不符合法定形式，受理机构出具《补正材料通知书》一次性告知申请人需要补正的材料;申请事项不需要取得行政许可或不属于本机关职权范围的，受理机构出具《不予受理通知书》。
2、审查工作人员对申请材料进行真实性、合法性审查;特殊程序需要申请人配合的环节，申请人应积极配合。
3、决定决定机构作出准予许可或不予许可的决定
4、制证发证
(1)不予许可的事项发给《不予许可决定书》，通知申报单位。
(2)准予许可的，及时通知申报单位，发给许可决定书或和许可证书。
5、中止若申请单位因违法违规等问题被立案调查尚未结案的，或者收到行政处罚决定尚未履行的，应当终止许可，直至案件处理完毕。
6、终止
(1)申请人提交的行政许可资料，行政受理机构尚未作出受理决定的，原申请人可向行政受理机构书面申请终止申报，行政受理机构应当自收到申请之日起5个工作日内退回其全部申请资料，并注明原因。
(2)申请人自愿撤回行政机关已经受理的行政许可申请的，应在行政机关作出许可决定之前书面明确撤回的意思表示，由行政机关收回《行政许可申请受理通知书》。通过上述分析知道，依据《海商法》的规定，设定船舶抵押权，船舶所有人和抵押权人要签订抵押合同，由抵押权人和抵押人共同向船舶登记机关办理抵押权登记;未经登记的，不得对抗第三人。如果需要法律方面的帮助，读者可以到知律律进行咨询。

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